Antimicrobiële peptiden (AMP’s) spelen een belangrijke rol in de verdediging van orale weefsels. AMP’s bezitten een netto positieve lading en hebben amfipathische eigenschappen. Ze binden aan membranen van micro-organismen, waardoor deze lek raken en de bacterie of schimmel sterft. Speeksel bevat drie groepen AMP’s: histatinen, defensinen en het cathelicidine peptide LL-37. Alle drie doden ze een breed scala aan micro-organismen en schimmels. Verder hebben ze epitheelcel-stimulerende eigenschappen en versnellen ze wondgenezing. Daarnaast bezitten LL-37 en defensinen ook immuunmodulerende eigenschappen. Vanwege hun simpele structuur zijn AMP’s relatief gemakkelijk op grote schaal te maken. Hierdoor zijn ze potentieel toepasbaar als breedwerkende antimicrobiële agentia.