In de rationale wordt naar voren gebracht dat COMET niet zozeer gericht is op het rechtstreeks corrigeren van negatieve zelfkennis. De interventie richt zich in eerste instantie op het versterken van positieve zelfkennis, opdat deze competitiever wordt ten opzichte van de bestaande negatieve zelfopvattingen. Er wordt verwacht dat zo’n versterking de negatieve zelfkennis vanzelf minder relevant en minder dominant zal maken in het dagelijks doen en laten van de cliënt. Onder het versterken van positieve zelfkennis wordt verstaan dat positieve zelfopvattingen die in het geheugen zijn opgeslagen, beter toegankelijk en gemakkelijker activeerbaar worden gemaakt. De persoonlijke doelen die de cliënt met de COMET-behandeling nastreeft, worden vervolgens in deze stap zo concreet mogelijk geformuleerd en vastgelegd. Deze doelen zijn de ‘bakens’ waarop de behandeling vaart. Tijdens de COMET-behandeling vinden korte tussenevaluaties plaats om na te gaan of de behandeling voldoende op koers ligt. Indien dat niet het geval is, moet de koers worden aangepast.
