De standaardbehandeling van constitutioneel eczeem bestaat uit de dagelijkse applicatie van indifferente middelen en de tijdelijke toepassing van corticosteroïdzalven bij opvlamming van het eczeem. Sinds enkele jaren zijn de calcineurineremmers tacrolimus en pimecrolimus beschikbaar gekomen. Tacrolimus is effectiever dan klasse-1-corticosteroïden en minstens zo effectief als klasse-2-preparaten. Pimecrolimus is minder werkzaam.
De meest voorkomende bijwerkingen zijn branderigheid op de applicatieplaats en irritatie van de huid. Wel is er enige zorg over een mogelijk toegenomen risico op het ontstaan van maligniteiten.
De calcineurineremmers mogen nooit als eerste behandeling worden ingezet. Hun toepassing is beperkt tot volwassenen en kinderen ouder dan 2 jaar die onvoldoende hebben gereageerd op corticosteroïden, die daar bijwerkingen van hebben ondervonden of die afhankelijk zijn van dagelijks gebruik van corticosteroïden over een lange periode. Langdurig gebruik moet worden vermeden. Tacrolimus verdient de voorkeur boven pimecrolimus.